冻干机的自动控制系统，许多冻干机带有自动控制系统，并同时兼备有手动控制功能。所谓冻干机的自动控制应该包括二个部分，一是冻干机的各零部件按冻干工艺要求在规定的时间自动运行开关；

二是干燥室板层温度按冻干曲线要求自动跟踪，整个冻干进程不需要人工操作，操作人员仅负责监控。实验室系列冻干机，冷冻干燥机分类，实验系列的冻干机用于研发之用，冷阱的结冰量每批次一般都是低于6公斤，干燥室的板层面积小于0.2平方米。中试及小规模生产系列用于中试模拟冻干工艺及小批量生产之用，冷阱的结冰量每批次一般都在6~25公斤之间，干燥室的板层面积在 0.2~2.0 平方米之间。

工业生产系列的冻干机用于工厂大规模生产之用，冷阱的结冰量每批次在40公斤以上，甚至有些达到1000公斤以上，而干燥室的板层面积在2平米以上，甚至有些达到100平方米左右。冻干机容量的选择思路：一般可以参考冻干机的板层面积即盘装法和瓶装法。盘装法充分利用了板层面积，而瓶装法由于瓶之间的间隙未充分利用，所需的板层面积较大。下面按盘装和瓶装两种工艺分别予以计算：